Вообщем не знаю есть ли тут поддержка, но может кому пригодиться мой обход этой проблемы Находим в плагине файл yandexkassa_gateway.class.php и комитим строку 148 в которой происходит обнуление корзины $woocommerce->cart->empty_cart();
Затем просим поддержку яндекс кассы чтобы при нажатии на ссылку вернуться в магазин клиентов кидало обратно на страницу корзины, а не на главную.
Это решение являеться хаком в ядро плагина, и может быть подавлено при следующем
его обновлении, как подавить это через файлы темы я найти не смог если кто из читающих это подскажет буду признателен.
