Buenas tardes, a mi me ha ocurrido lo mismo. Tras la última actualización del plugin, me han aparecido problemas con ciertos archivos con error 404.
Si no puedes volver a la versión anterior, yo he hecho es lo siguiente:
acceder a la ruta: httpdocs>wp-content>plugins>addons-for-divi>assets>libs>magnific-popup
Descargar una copia de los archivos .js y .css, renombrarlos y subirlos al servidor (mantén los anteriores).
Es decir, subir los archivos: magnific-popup.js; magnific-popup.min.css y magnific-popup.min.js (quitando el jquery. del principio)
Yo entiendo que lo que ha pasado en esta actualización es que han cambiado los nombres de los archivos pero habrán archivos con referencia al nombre anterior.
Espero poder ayudar y haber sido clara.
De todas formas esto debería de corregirse por el autor del plugin.